Nama Madrasah Aliyah Negeri (MAN) 3 Kediri identik dengan nama madrasah favorit dan bergengsi karena prestasi. Madrasah kesayangan dan kebanggaan kita ini tidak tiba-tiba semegah dan sehebat yang kita lihat sekarang ini. Tulisan berikut ini mengajak anda flash back tentang perjalanan MAN 3 Kediri mulai dari cikal-bakal-nya, menjadi filial, dinegerikan sampai dengan saat ini
Cikal-bakal MAN 3 Kediri berawal dari Madrasah Aliyah Islakhiyah Bobosan berdiri tahun 1981 atas prakarsa Bapak Muhary Ridwan L.Ph. Bapak Fauzan Said, A.Md., Bapak H. Kholil Ridwan, Bapak Drs. H. Syamsi Ridwan, Bapak Drs. Binyali serta tokoh agama dan masyarakat yang lain.
Tahun 1984 Madrasah Aliyah Islakhiyah Bobosan menjadi filial MAN Purwoasri. Dari tahun 1987 proses belajar mengajar berjalan dengan lancar, namun setelah wafatnya Bapak Muhary Ridwan L.Ph, pendiri madrasah tahun 1989 perkembangan madrasah mengalami penurunan. Tahun 1990 demi perkembangan madrasah dewan guru dan tokoh masyarakat termasuk para pendiri yang masih ada sepakat untuk memindahkan madrasah ke tengah kota di SMP Diponegoro jalan Jombang Kandangan dengan proses belajar mengajar sore hari. Mengingat jumlah siswa yang semakin meningkat, SMP Diponegoro tidak mencukupi tahun 1994 MAN Filial Purwoasri di Kandangan pindah ke SMP Islam yayasan Walisongo di Gedangan Kandangan dengan proses belajar mengajar pagi hari.
17 Maret 1997 MAN filial Purwoasri di Kandangan dinegerikan oleh Menteri Agama menjadi Madrasah Aliyah Negeri (MAN) Kandangan Kabupaten Kediri dengan SK. Nomor : 107.
Tahun 1998 MAN Kandangan sudah mampu membeli tanah. Tahun 1999 membangun 4 ruang di Desa Kasreman Jl. Jombang Kandangan sehingga siswa yang menempati SMA Muhammadiyah Kandangan dipindahkan ke gedung baru alamat MAN Kandangan saat ini jalan Jombang Kasreman Kandangan.
Daftar Nama Kepala Madrasah dari Masa ke Masa
| No | Nama | Tahun | Keterangan |
| 1 | Muharry Ridlwan, L.Ph | 1980 – 1984
1984 – 1989 |
Mulai berdiri
Filial MAN Purwoasri |
| 2 | Fauzan Said, A.Md | 1989 – 1990 | Filial MAN Purwoasri |
| 3 | Drs. H. Djamil Aly | 1990 – 1997
1997 – 2004 |
FilialMAN Purwoasri
MAN Kandangan |
| 4 | Drs. H. Imronuddin Huda, S.Pd. | 2004 – 2006 | MAN Kandangan |
| 5 | Drs. H. Djamil Aly | 2006 – 2010 | MAN Kandangan |
| 6 | H. Tsani Muallief, S.Ag | 2010 – 2012 | MAN Kandangan |
| 7 | H. Suyatno, M.Pd.I | 2012 – 2016 | MAN Kandangan |
| 8 | Drs. Slamet Hariyanto, M.Pd.I | 2016 – sekarang | MAN 3 Kediri |
MAN Kandangan Kabupaten Kediri ditetapkan oleh Kepala Kantor Wilayah Kementerian Agama Provinsi Jawa Timur sebagai Penyelenggara Program Kelas Percepatan Belajar (Akselerasi) berdasarkan SK Kepala Kantor Wilayah Kementerian Agama Prov. Jawa Timur Nomor : Kw.13.4/1/PP.00.6/1126/SK/2011 dan pada tanggal 9 Juni 2015 melalui Keputusan Direktur Jendral Pendidikan Islam Nomor : 3274 Tahun 2015 MAN Kandangan ditetapkan sebagai Madrasah Penyelenggara Sistem Kredit Semester (SKS) mulai tahun pelajaran 2014/2015, sekaligus sebagai Madrasah Penyelenggara Kurikulum 2013.
Pada akreditasi yang pertama tahun 2009 dan yang kedua tahun 2014 MAN Kandangan memperoleh predikat terakreditasi dengan nilai “A” berdasarkan SK Penetapan Hasil Akreditasi BAP-S/M Nomor : 300/BAP-SM/SK/XI/2014.
17 November 2016 Madrasah Aliyah Negeri (MAN) Kandangan berubah nama menjadi MAN 3 Kediri berdasarkan keputusan Menteri Agama Republik Indonesia ( Lukman Hakim Saifuddin) Nomor : 673 Tahun 2016. Perubahan nama tersebut serentak bersama 83 MAN se-Jawa Timur.
Saat ini, MAN 3 Kediri memiliki 4 program peminatan, yakni: Ilmu Bahasa dan Budaya (IBB), Ilmu-Ilmu Keagamaan (IIK), Ilmu-Ilmu Sosial IIS), dan Matematika dan Ilmu Alam (MIA). Lebih baik madrasah, madrasah lebih baik. MAN 3 Kediri lebih baik, lebih baik MAN 3 Kediri. MAN 3 Kediri membangun karakter bangsa. MAN 3 Kediri berkualitas dan berprestasi pasti.